O AME Caraguatatuba, em regime ambulatorial, também realiza cirurgias de baixa e média complexidade, nas especialidades: Cirurgia Geral, Cirurgia Pediátrica, Cirurgia Plástica, Cirurgia Vascular, Dermatologia, Mastologia, Oftalmologia, Ortopedia/Traumatologia, Otorrinolaringologia, Proctologia e Urologia.

A unidade conta com três salas de cirurgia, uma sala de Recuperação Pós-Anestésica (RPA), uma sala para pequenos procedimentos cirúrgicos, duas salas para realização de exames de Endoscopia e Colonoscopia com e/ou sem biópsias.  

Atualmente, as cirurgias oftalmológicas estão entre os principais procedimentos realizados na unidade em atendimento à demanda regional.